Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd247P24161 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd247P24161 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cd247P24161 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd247P24161 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd247P24161 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd247P24161 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cd247P24161 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd247P24161 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd247P24161 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd247P24161 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd247P24161 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd247P24161 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd247P24161 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd247P24161 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd247P24161 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd247P24161 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd247P24161 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd247P24161 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd247P24161 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd247P24161 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd247P24161 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cd247P24161 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cd247P24161 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd247P24161 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd247P24161 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd247P24161 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd247P24161 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd247P24161 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd247P24161 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd247P24161 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd247P24161 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd247P24161 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd247P24161 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd247P24161 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd247P24161 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd247P24161 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd247P24161 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd247P24161 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms