Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd12P23812 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd12P23812 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms