Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxd8P23463 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Hoxd8P23463 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxd8P23463 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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