Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ggta1P23336 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ggta1P23336 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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