Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkchP23298 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkchP23298 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms