Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eif3aP23116 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms