Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SftpcP21841 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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SftpcP21841 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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SftpcP21841 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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SftpcP21841 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SftpcP21841 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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SftpcP21841 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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