Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VimP20152 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VimP20152 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VimP20152 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VimP20152 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VimP20152 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VimP20152 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VimP20152 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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