Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a1P19437 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms