Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms