Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ifrd1P19182 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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