Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RargP18911 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RargP18911 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RargP18911 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms