Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rps6ka1P18653 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps6ka1P18653 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms