Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
P18529 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
P18529 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
P18529 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
P18529 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
P18529 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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