Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
P18528 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
P18528 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
P18528 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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