Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Calb1P12658 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms