Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp1P11438 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp1P11438 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp1P11438 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp1P11438 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lamp1P11438 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamp1P11438 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamp1P11438 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamp1P11438 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamp1P11438 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamp1P11438 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamp1P11438 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lamp1P11438 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lamp1P11438 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms