Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RaraP11416 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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RaraP11416 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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RaraP11416 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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RaraP11416 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RaraP11416 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RaraP11416 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RaraP11416 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RaraP11416 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RaraP11416 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RaraP11416 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RaraP11416 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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