Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PolP11369 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PolP11369 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PolP11369 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolP11369 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PolP11369 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PolP11369 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolP11369 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolP11369 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolP11369 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolP11369 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PolP11369 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolP11369 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolP11369 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolP11369 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PolP11369 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PolP11369 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PolP11369 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PolP11369 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolP11369 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PolP11369 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolP11369 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolP11369 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolP11369 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolP11369 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolP11369 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolP11369 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PolP11369 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms