Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Tnp1P10856 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms