Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxb4P10284 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb4P10284 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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