Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Schip1P0DPB4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Schip1P0DPB4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms