Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CatspereP0DP43 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms