Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms