Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxc8P09025 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxc8P09025 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms