Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TtrP07309 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TtrP07309 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TtrP07309 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TtrP07309 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TtrP07309 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TtrP07309 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TtrP07309 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TtrP07309 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TtrP07309 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TtrP07309 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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TtrP07309 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TtrP07309 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TtrP07309 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TtrP07309 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TtrP07309 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TtrP07309 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TtrP07309 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TtrP07309 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TtrP07309 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TtrP07309 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TtrP07309 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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