Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SparcP07214 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SparcP07214 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SparcP07214 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SparcP07214 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SparcP07214 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SparcP07214 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SparcP07214 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SparcP07214 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SparcP07214 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SparcP07214 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms