Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

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Length 605 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AfpP02772 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AfpP02772 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AfpP02772 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AfpP02772 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AfpP02772 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AfpP02772 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AfpP02772 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AfpP02772 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AfpP02772 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AfpP02772 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AfpP02772 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AfpP02772 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms