Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01648 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01648 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01648 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01648 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01648 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01648 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01648 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01648 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01648 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01648 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01648 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P01648 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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P01648 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01648 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01648 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01648 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01648 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01648 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01648 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01648 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01648 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01648 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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P01648 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01648 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01648 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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P01648 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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P01648 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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P01648 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01648 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01648 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01648 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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P01648 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01648 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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