Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01641 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01641 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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P01641 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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P01641 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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P01641 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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P01641 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01641 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01641 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01641 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01641 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01641 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01641 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01641 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01641 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01641 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01641 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01641 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01641 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01641 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01641 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01641 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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