Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnb1P01575 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ifnb1P01575 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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