Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ccl20O89093 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccl20O89093 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ccl20O89093 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ccl20O89093 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ccl20O89093 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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