Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CopeO89079 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CopeO89079 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CopeO89079 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopeO89079 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopeO89079 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopeO89079 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopeO89079 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopeO89079 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CopeO89079 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms