Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc6O88978 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Lrrc6O88978 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Lrrc6O88978 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Lrrc6O88978 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Lrrc6O88978 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc6O88978 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Lrrc6O88978 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms