Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ShdO88834 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ShdO88834 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ShdO88834 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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ShdO88834 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ShdO88834 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ShdO88834 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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