Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BlmO88700 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BlmO88700 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BlmO88700 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BlmO88700 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BlmO88700 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BlmO88700 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BlmO88700 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BlmO88700 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BlmO88700 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BlmO88700 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BlmO88700 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BlmO88700 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BlmO88700 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BlmO88700 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BlmO88700 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BlmO88700 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BlmO88700 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BlmO88700 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BlmO88700 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BlmO88700 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BlmO88700 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BlmO88700 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms