Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms