Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb5O70309 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms