Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rpl35aO55142 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rpl35aO55142 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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