Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Dsg2O55111 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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