Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ptpn20O55082 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ptpn20O55082 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms