Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BckdkO55028 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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BckdkO55028 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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BckdkO55028 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BckdkO55028 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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BckdkO55028 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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BckdkO55028 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdkO55028 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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BckdkO55028 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BckdkO55028 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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