Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn5O54942 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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