Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms