Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrxO54751 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CrxO54751 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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CrxO54751 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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CrxO54751 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CrxO54751 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CrxO54751 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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