Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FxnO35943 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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FxnO35943 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FxnO35943 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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