Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CaluO35887 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaluO35887 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaluO35887 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaluO35887 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaluO35887 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaluO35887 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaluO35887 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaluO35887 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CaluO35887 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CaluO35887 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CaluO35887 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CaluO35887 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms