Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Klf12O35738 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf12O35738 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Klf12O35738 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms