Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 1700016H13Rik-202ENSMUST00000119824 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx8O35652 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx8O35652 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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