Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Slc1a6O35544 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc1a6O35544 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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